A denúncia foi feita pela revista semanal alemã Focus, que cita um diretor da agência que preferiu não se identificar.
O governo disse que uma comissão está investigando o que classificou de "assunto sério".
"Não foi possível ainda verificar a autenticidade dos relatos, mas uma investigação foi iniciada neste sentido na sexta-feira", disse o porta-voz do governo Steffen Seibert.
Tecnologia
O novo prédio de 1.6 bilhões de euros (mais de R$ 4 bilhões) está sendo erguido em Berlim.
O edifício está previsto para ser inaugurado em 2014 e será um das construções mais caras e de alta tecnologia do país.
A planta mostraria detalhes extremamente sigilosos do prédio, como sistemas de alarme, instalações antiterrorismo, saídas de emergência e instalações de cabos e esgotos.
Analistas dizem que, se a notícia for confirmada, será um risco sério para a segurança do país e uma desmoralização para o serviço secreto.